Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCINQ13939 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCINQ13939 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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