Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SHROOM2Q13796 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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SHROOM2Q13796 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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SHROOM2Q13796 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
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SHROOM2Q13796 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SHROOM2Q13796 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SHROOM2Q13796 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
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