Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TUBA3CQ13748 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TUBA3CQ13748 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TUBA3CQ13748 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TUBA3CQ13748 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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