Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE3BQ13370 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE3BQ13370 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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