Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3B2Q13367 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AP3B2Q13367 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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