Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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