Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFT88Q13099 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IFT88Q13099 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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