Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIK3Q13003 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GRIK3Q13003 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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