Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXC1Q12948 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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FOXC1Q12948 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXC1Q12948 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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