Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TROQ12816 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TROQ12816 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TROQ12816 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TROQ12816 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TROQ12816 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TROQ12816 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TROQ12816 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms