Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SREBF2Q12772 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREBF2Q12772 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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