Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YCS4YLR272C 3531 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 CDC36YDL165W 576 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 NHP2YDL208W 471 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YDR048CYDR048C 315 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YDR413CYDR413C 576 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YOR199WYOR199W 330 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 SPC98YNL126W 2541 nt1.41□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 AHC1YOR023C 1701 nt1.4□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 SEC3YER008C 4011 nt1.4□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 SLI15YBR156C 2097 nt1.4□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YAR029WYAR029W 225 nt1.4□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 RAD9YDR217C 3930 nt1.39□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 APL3YBL037W 3078 nt1.39□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 LCD1YDR499W 2244 nt1.39□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.39□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 PBY1YBR094W 2262 nt1.39□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YFL032WYFL032W 321 nt1.38□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 MAD1YGL086W 2250 nt1.38□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.38□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 MDS3YGL197W 4464 nt1.38□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 NUP145YGL092W 3954 nt1.38□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 FIG4YNL325C 2640 nt1.37□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 TAR1YLR154W-C 375 nt1.37□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YOL160WYOL160W 342 nt1.37□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 RPS30BYOR182C 192 nt1.37□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 EAF1YDR359C 2949 nt1.36□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.36□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 SPO75YLL005C 2607 nt1.36□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.36□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 MMS4YBR098W 2076 nt1.35□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.35□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 SET3YKR029C 2256 nt1.35□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 STB6YKL072W 2301 nt1.34□□□□□ -2.19
RTP1Q12751 SIP4YJL089W 2490 nt1.33□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 ALY2YJL084C 3141 nt1.33□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YER097WYER097W 330 nt1.33□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 CDC39YCR093W 6327 nt1.33□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 STO1YMR125W 2586 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YGL149WYGL149W 306 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 MAM33YIL070C 801 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 DBP6YNR038W 1890 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 SLD3YGL113W 2007 nt1.32□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YAR009CYAR009C 3591 nt1.31□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.31□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 INA22YIR024C 651 nt1.3□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YNL146WYNL146W 303 nt1.3□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 RAD34YDR314C 2079 nt1.3□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 PDE2YOR360C 1581 nt1.3□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 RPL39YJL189W 156 nt1.29□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.29□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.28□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 OST1YJL002C 1431 nt1.28□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 STE5YDR103W 2754 nt1.28□□□□□ -2.2
RTP1Q12751 PKH2YOL100W 3246 nt1.28□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YDL206WYDL206W 2289 nt1.27□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 CUL3YGR003W 2235 nt1.27□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YFL063WYFL063W 456 nt1.27□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.27□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 RPL33BYOR234C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 snR60snR60 104 nt1.26□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 SSS1YDR086C 243 nt1.26□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 GPG1YGL121C 381 nt1.26□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YIL032CYIL032C 357 nt1.26□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 RPL34BYIL052C 366 nt1.26□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YCK3YER123W 1575 nt1.25□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 HTL1YCR020W-B 237 nt1.25□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 QCR9YGR183C 201 nt1.25□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 NIP100YPL174C 2607 nt1.24□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 NST1YNL091W 3723 nt1.24□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YIR044CYIR044C 186 nt1.24□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 IFH1YLR223C 3258 nt1.23□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 PAM16YJL104W 450 nt1.23□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YLL007CYLL007C 1998 nt1.23□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 WAR1YML076C 2835 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 NUP157YER105C 4176 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 APL1YJR005W 2103 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 BUD3YCL014W 4911 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 PTP2YOR208W 2253 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YJR029WYJR029W 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
RTP1Q12751 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.21□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 HMRA2YCR096C 360 nt1.2□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.2□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 SMC1YFL008W 3678 nt1.2□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 PAN2YGL094C 3348 nt1.2□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 ALG13YGL047W 609 nt1.19□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 YHL042WYHL042W 453 nt1.19□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 ROM2YLR371W 4071 nt1.19□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 VIK1YPL253C 1944 nt1.17□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 SPT7YBR081C 3999 nt1.17□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 snR65snR65 100 nt1.17□□□□□ -2.22
RTP1Q12751 YDR344CYDR344C 444 nt1.17□□□□□ -2.22
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