Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YJL015CYJL015C 285 nt1.1□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 PIP2YOR363C 2991 nt1.1□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 AZF1YOR113W 2745 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SLI15YBR156C 2097 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 TAR1YLR154W-C 375 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 RRT15YLR162W-A 189 nt1.09□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 MSH3YCR092C 3057 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR521WYDR521W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YAR029WYAR029W 225 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YBR206WYBR206W 324 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.08□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR048CYDR048C 315 nt1.07□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YLL020CYLL020C 306 nt1.07□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YPR063CYPR063C 423 nt1.07□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YCK3YER123W 1575 nt1.06□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 RPL34BYIL052C 366 nt1.06□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 STO1YMR125W 2586 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 PAN2YGL094C 3348 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 SSS1YDR086C 243 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR344CYDR344C 444 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 PRP16YKR086W 3216 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 OST1YJL002C 1431 nt1.05□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YLL054CYLL054C 2532 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 NHP2YDL208W 471 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 INA22YIR024C 651 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 ROM2YLR371W 4071 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDL206WYDL206W 2289 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 NUP157YER105C 4176 nt1.04□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 KAP120YPL125W 3099 nt1.03□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.03□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YJL120WYJL120W 324 nt1.03□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YDL073WYDL073W 2955 nt1.03□□□□□ -2.24
HMS1Q12398 YAR009CYAR009C 3591 nt1.03□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 FIG4YNL325C 2640 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 LAA1YJL207C 6045 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 NST1YNL091W 3723 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YGR130CYGR130C 2451 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YHL042WYHL042W 453 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 PKH2YOL100W 3246 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YBR064WYBR064W 429 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 SEC3YER008C 4011 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 NUP145YGL092W 3954 nt1.02□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 MMS4YBR098W 2076 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 PDE2YOR360C 1581 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YER097WYER097W 330 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YFL063WYFL063W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 Q0142Q0142 177 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YIR044CYIR044C 186 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 SPO21YOL091W 1830 nt1.01□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YLL007CYLL007C 1998 nt1□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 HTL1YCR020W-B 237 nt1□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YFL032WYFL032W 321 nt1□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 GPG1YGL121C 381 nt1□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YKL118WYKL118W 312 nt1□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 snR36snR36 182 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 SIP4YJL089W 2490 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YJR029WYJR029W 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 DBP6YNR038W 1890 nt0.99□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 CUL3YGR003W 2235 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YDR413CYDR413C 576 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 RPS25BYLR333C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 BUD3YCL014W 4911 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 ASE1YOR058C 2658 nt0.97□□□□□ -2.25
HMS1Q12398 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.96□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 COG8YML071C 1824 nt0.95□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 IML1YJR138W 4755 nt0.94□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 PTP2YOR208W 2253 nt0.94□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 SCC2YDR180W 4482 nt0.93□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 MCM10YIL150C 1716 nt0.93□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 AIM44YPL158C 2277 nt0.93□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 ALG13YGL047W 609 nt0.93□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 WAR1YML076C 2835 nt0.92□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 HMRA2YCR096C 360 nt0.92□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.92□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 STE5YDR103W 2754 nt0.92□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 CLU1YMR012W 3834 nt0.91□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 YDL196WYDL196W 330 nt0.91□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 YIL032CYIL032C 357 nt0.91□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.91□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.91□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 SPT7YBR081C 3999 nt0.9□□□□□ -2.26
HMS1Q12398 snR60snR60 104 nt0.9□□□□□ -2.27
HMS1Q12398 YKL136WYKL136W 399 nt0.9□□□□□ -2.27
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