Protein–RNA interactions for Protein: Q12262

MCM16, Inner kinetochore subunit MCM16, yeastyeast

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCM16Q12262 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 FAR11YNL127W 2862 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 AGC1YPR021C 2709 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 APL1YJR005W 2103 nt2.78□□□□□ -1.96
MCM16Q12262 PDR1YGL013C 3207 nt2.78□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 CHS6YJL099W 2241 nt2.77□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 NEW1YPL226W 3591 nt2.77□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 CTR9YOL145C 3234 nt2.77□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 YDL118WYDL118W 381 nt2.76□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 STF2YGR008C 255 nt2.76□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 YOR055WYOR055W 435 nt2.76□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 DBP10YDL031W 2988 nt2.75□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 ESC1YMR219W 4977 nt2.75□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 MLH1YMR167W 2310 nt2.74□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 TRL1YJL087C 2484 nt2.74□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 COG4YPR105C 2586 nt2.73□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 CDC60YPL160W 3273 nt2.73□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 TOP2YNL088W 4287 nt2.73□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 SSD1YDR293C 3753 nt2.72□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 SLI15YBR156C 2097 nt2.72□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.72□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 SYH1YPL105C 2550 nt2.72□□□□□ -1.97
MCM16Q12262 BNR1YIL159W 4128 nt2.71□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 NAB6YML117W 3405 nt2.71□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YDR209CYDR209C 414 nt2.71□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 PET309YLR067C 2898 nt2.71□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 UBP15YMR304W 3693 nt2.7□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YLL054CYLL054C 2532 nt2.7□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 RTT107YHR154W 3213 nt2.7□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.7□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 IRE1YHR079C 3348 nt2.7□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 HSL1YKL101W 4557 nt2.69□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 SVL3YPL032C 2478 nt2.69□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YNL144CYNL144C 2223 nt2.69□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 STE11YLR362W 2154 nt2.68□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 IRC8YJL051W 2469 nt2.68□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 RCO1YMR075W 2055 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 ADR1YDR216W 3972 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 UBP1YDL122W 2430 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 NUM1YDR150W 8247 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YGL182CYGL182C 324 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.67□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 KRE33YNL132W 3171 nt2.66□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YDL206WYDL206W 2289 nt2.66□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 RPL37BYDR500C 267 nt2.66□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 TRM3YDL112W 4311 nt2.66□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 TDA9YML081W 3756 nt2.65□□□□□ -1.98
MCM16Q12262 YLL020CYLL020C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 LHS1YKL073W 2646 nt2.65□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 UTP8YGR128C 2142 nt2.65□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 FRK1YPL141C 2598 nt2.64□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 GIP3YPL137C 3831 nt2.64□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 SPF1YEL031W 3648 nt2.63□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.63□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.62□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 VPS13YLL040C 9435 nt2.62□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 SGS1YMR190C 4344 nt2.62□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 GCN2YDR283C 4980 nt2.62□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 snR62snR62 100 nt2.61□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 RTT101YJL047C 2529 nt2.61□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 SGM1YJR134C 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.6□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 QCR9YGR183C 201 nt2.6□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 UFD2YDL190C 2886 nt2.6□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 CHC1YGL206C 4962 nt2.6□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 MSB1YOR188W 3414 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 RAV1YJR033C 4074 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 IST2YBR086C 2841 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 BFR2YDR299W 1605 nt2.59□□□□□ -1.99
MCM16Q12262 YJR039WYJR039W 3366 nt2.59□□□□□ -2
MCM16Q12262 STB6YKL072W 2301 nt2.58□□□□□ -2
MCM16Q12262 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.58□□□□□ -2
MCM16Q12262 POL5YEL055C 3069 nt2.57□□□□□ -2
MCM16Q12262 DNF1YER166W 4716 nt2.57□□□□□ -2
MCM16Q12262 SLN1YIL147C 3663 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.56□□□□□ -2
MCM16Q12262 YOL098CYOL098C 3114 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 snR81snR81 201 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 YPP1YGR198W 2454 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 RSM22YKL155C 1887 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 SFB2YNL049C 2631 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 SEY1YOR165W 2331 nt2.55□□□□□ -2
MCM16Q12262 SEC63YOR254C 1992 nt2.54□□□□□ -2
MCM16Q12262 TBS1YBR150C 3285 nt2.54□□□□□ -2
MCM16Q12262 YEF3YLR249W 3135 nt2.54□□□□□ -2
MCM16Q12262 MDS3YGL197W 4464 nt2.54□□□□□ -2
MCM16Q12262 TIM9YEL020W-A 264 nt2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms