Protein–RNA interactions for Protein: Q12146

PSF3, DNA replication complex GINS protein PSF3, yeastyeast

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF3Q12146 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 snR49snR49 165 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 PKH3YDR466W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 SXM1YDR395W 2835 nt1.76□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 CUL3YGR003W 2235 nt1.75□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YBR064WYBR064W 429 nt1.75□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 VPS54YDR027C 2670 nt1.75□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 RAD50YNL250W 3939 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 IML1YJR138W 4755 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 HUG1YML058W-A 207 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YMR321CYMR321C 318 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YOR015WYOR015W 360 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 UFD2YDL190C 2886 nt1.74□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 COG4YPR105C 2586 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 SLI15YBR156C 2097 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 RPS27BYHR021C 249 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YJL120WYJL120W 324 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 RPS25BYLR333C 327 nt1.73□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 SSK2YNR031C 4740 nt1.72□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 COF1YLL050C 432 nt1.72□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 VPS15YBR097W 4365 nt1.72□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 SPO21YOL091W 1830 nt1.72□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 PDE2YOR360C 1581 nt1.72□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 PTP2YOR208W 2253 nt1.71□□□□□ -2.13
PSF3Q12146 SEC5YDR166C 2916 nt1.71□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YLL007CYLL007C 1998 nt1.71□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YGL052WYGL052W 306 nt1.71□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 IES4YOR189W 351 nt1.71□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 KAP122YGL016W 3246 nt1.71□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 PIK1YNL267W 3201 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 ALK1YGL021W 2283 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 SMC4YLR086W 4257 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 SLX4YLR135W 2247 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YGL217CYGL217C 342 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YOR218CYOR218C 420 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 PKH2YOL100W 3246 nt1.7□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.69□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.69□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 IFH1YLR223C 3258 nt1.69□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YCS4YLR272C 3531 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YDR521WYDR521W 336 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YGL041CYGL041C 204 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 VPS55YJR044C 423 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YLR140WYLR140W 327 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YOR376WYOR376W 369 nt1.68□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 snR55snR55 98 nt1.67□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 snR80snR80 171 nt1.67□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 ABF2YMR072W 552 nt1.67□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.67□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 ALY2YJL084C 3141 nt1.66□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.66□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.66□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 YBR206WYBR206W 324 nt1.66□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 NCA2YPR155C 1851 nt1.65□□□□□ -2.14
PSF3Q12146 PBY1YBR094W 2262 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 GPG1YGL121C 381 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 snR14snR14 160 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YPR092WYPR092W 306 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YBR174CYBR174C 315 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YOR019WYOR019W 2193 nt1.64□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 ADR1YDR216W 3972 nt1.63□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.63□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 BST1YFL025C 3090 nt1.63□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 MCM10YIL150C 1716 nt1.63□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 TRM732YMR259C 4263 nt1.63□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.62□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YLL054CYLL054C 2532 nt1.62□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 TTI1YKL033W 3117 nt1.62□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 CDC36YDL165W 576 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.61□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 MDS3YGL197W 4464 nt1.6□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 SPG3YDR504C 384 nt1.6□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YDL206WYDL206W 2289 nt1.6□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 SLD3YGL113W 2007 nt1.59□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 MMS4YBR098W 2076 nt1.59□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 YAR009CYAR009C 3591 nt1.59□□□□□ -2.15
PSF3Q12146 PAN2YGL094C 3348 nt1.58□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 AIM44YPL158C 2277 nt1.58□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.58□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 SGF11YPL047W 300 nt1.58□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 NPR2YEL062W 1848 nt1.58□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 snR74snR74 88 nt1.57□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 CLU1YMR012W 3834 nt1.57□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 AHC1YOR023C 1701 nt1.56□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.55□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.55□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 UBP3YER151C 2739 nt1.55□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 FIG4YNL325C 2640 nt1.54□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 EST2YLR318W 2655 nt1.54□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.54□□□□□ -2.16
PSF3Q12146 RRT15YLR162W-A 189 nt1.54□□□□□ -2.16
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