Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt3□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 KAP120YPL125W 3099 nt2.99□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 IST2YBR086C 2841 nt2.99□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 UFD2YDL190C 2886 nt2.99□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 RSE1YML049C 4086 nt2.99□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 YDL206WYDL206W 2289 nt2.98□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 YJR039WYJR039W 3366 nt2.97□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 ESL1YIL151C 3357 nt2.97□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 SAP1YER047C 2694 nt2.96□□□□□ -1.93
TFB4Q12004 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YER138CYER138C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YER160CYER160C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YJR027WYJR027W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YML039WYML039W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YML045WYML045W 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YMR050CYMR050C 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 SLI15YBR156C 2097 nt2.96□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 POL3YDL102W 3294 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 AMS1YGL156W 3252 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR209CYDR209C 414 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 SCP160YJL080C 3669 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 BUD2YKL092C 3315 nt2.95□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YDR210WYDR210W 228 nt2.94□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 SGM1YJR134C 2124 nt2.94□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 snR53snR53 91 nt2.94□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 SEC1YDR164C 2175 nt2.94□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.93□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.92□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 MET18YIL128W 3099 nt2.92□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 CAF120YNL278W 3183 nt2.92□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 AGC1YPR021C 2709 nt2.91□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 MRD1YPR112C 2664 nt2.91□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 POL5YEL055C 3069 nt2.91□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 PRP8YHR165C 7242 nt2.91□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 ADR1YDR216W 3972 nt2.9□□□□□ -1.94
TFB4Q12004 TBS1YBR150C 3285 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 SRB8YCR081W 4284 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 COX5BYIL111W 456 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 LCL1YPL056C 306 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 YIL169CYIL169C 2988 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 BPT1YLL015W 4680 nt2.89□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 NUP100YKL068W 2880 nt2.88□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.88□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 NUP157YER105C 4176 nt2.88□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 PNC1YGL037C 651 nt2.87□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 UBR1YGR184C 5853 nt2.86□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 RTP1YMR185W 2946 nt2.86□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 RTT107YHR154W 3213 nt2.85□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 NAB6YML117W 3405 nt2.85□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.85□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.85□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 TOM1YDR457W 9807 nt2.85□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 RPS26AYGL189C 360 nt2.84□□□□□ -1.95
TFB4Q12004 SEC26YDR238C 2922 nt2.84□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 RSM22YKL155C 1887 nt2.84□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 DBP10YDL031W 2988 nt2.83□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 CTR9YOL145C 3234 nt2.83□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 BNR1YIL159W 4128 nt2.83□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 FRK1YPL141C 2598 nt2.82□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.82□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.82□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 YLR232WYLR232W 348 nt2.81□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 MOT1YPL082C 5604 nt2.8□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 snR70snR70 164 nt2.8□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 CHC1YGL206C 4962 nt2.8□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 NMD2YHR077C 3270 nt2.8□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 YLR278CYLR278C 4026 nt2.79□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 ESC1YMR219W 4977 nt2.79□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 COA6YMR244C-A 315 nt2.79□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 GEA1YJR031C 4227 nt2.79□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 TRS130YMR218C 3309 nt2.78□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 GLG1YKR058W 1851 nt2.78□□□□□ -1.96
TFB4Q12004 TUS1YLR425W 3924 nt2.77□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 TRM3YDL112W 4311 nt2.77□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 YML002WYML002W 2214 nt2.77□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 ILS1YBL076C 3219 nt2.77□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 SEY1YOR165W 2331 nt2.76□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 TOR1YJR066W 7413 nt2.76□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 SEC21YNL287W 2808 nt2.76□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 HSL1YKL101W 4557 nt2.76□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 PSD2YGR170W 3417 nt2.75□□□□□ -1.97
TFB4Q12004 YEF3YLR249W 3135 nt2.75□□□□□ -1.97
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