Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC8Q09428 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms