Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DSC1Q08554 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC1Q08554 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms