Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 RPL37BYDR500C 267 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YEL073CYEL073C 324 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 ZIP2YGL249W 2115 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YIR044CYIR044C 186 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 IST2YBR086C 2841 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 RTT101YJL047C 2529 nt2.1□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 APL2YKL135C 2181 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 CDC60YPL160W 3273 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 COY1YKL179C 2040 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 HSL1YKL101W 4557 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 PAU3YCR104W 375 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.09□□□□□ -2.07
SGO1Q08490 ZIP1YDR285W 2628 nt2.09□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 NOC3YLR002C 1992 nt2.09□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 BUD2YKL092C 3315 nt2.08□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 USO1YDL058W 5373 nt2.08□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 MAK10YEL053C 2202 nt2.08□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YDL196WYDL196W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.08□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YFR016CYFR016C 3702 nt2.07□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.07□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 IRC20YLR247C 4671 nt2.07□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 MGA2YIR033W 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 UFD4YKL010C 4452 nt2.06□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 SAS3YBL052C 2496 nt2.06□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 MAD1YGL086W 2250 nt2.06□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 AHC1YOR023C 1701 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YHR210CYHR210C 1026 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 DCP2YNL118C 2913 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 YLL007CYLL007C 1998 nt2.05□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 CTR9YOL145C 3234 nt2.04□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 PEP1YBL017C 4740 nt2.03□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 MLH3YPL164C 2148 nt2.03□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 NCA2YPR155C 1851 nt2.03□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 FIG4YNL325C 2640 nt2.03□□□□□ -2.08
SGO1Q08490 KOG1YHR186C 4674 nt2.03□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 MSH6YDR097C 3729 nt2.02□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 PIG1YLR273C 1947 nt2.01□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 AIM44YPL158C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 DGR2YKL121W 2559 nt2.01□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 CTF4YPR135W 2784 nt2.01□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 HIR3YJR140C 4947 nt2.01□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 PET309YLR067C 2898 nt2□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 YDL118WYDL118W 381 nt2□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 YER172C-AYER172C-A 381 nt2□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 PIP2YOR363C 2991 nt2□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 UBR2YLR024C 5619 nt1.99□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 SNU13YEL026W 381 nt1.99□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 SEC31YDL195W 3822 nt1.99□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 HAL9YOL089C 3093 nt1.99□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.98□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 YMR045CYMR045C 5268 nt1.98□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 BRE1YDL074C 2103 nt1.97□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 TBS1YBR150C 3285 nt1.97□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 BPH1YCR032W 6504 nt1.97□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 GCN2YDR283C 4980 nt1.97□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 HMI1YOL095C 2121 nt1.97□□□□□ -2.09
SGO1Q08490 ATG9YDL149W 2994 nt1.96□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.96□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 PTP2YOR208W 2253 nt1.95□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.95□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 MYO4YAL029C 4416 nt1.95□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SAC3YDR159W 3906 nt1.95□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SLD3YGL113W 2007 nt1.95□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SEY1YOR165W 2331 nt1.94□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.94□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YDR521WYDR521W 336 nt1.94□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YPL044CYPL044C 549 nt1.94□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 ALK1YGL021W 2283 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YCS4YLR272C 3531 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 IFH1YLR223C 3258 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SEC63YOR254C 1992 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YBR206WYBR206W 324 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 IRE1YHR079C 3348 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 TRM3YDL112W 4311 nt1.93□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 FKS1YLR342W 5631 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 HUG1YML058W-A 207 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YNL144CYNL144C 2223 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SFB2YNL049C 2631 nt1.92□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 KCS1YDR017C 3153 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 PBY1YBR094W 2262 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 MYO2YOR326W 4725 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YOR102WYOR102W 351 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 RPS30BYOR182C 192 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 NUT1YGL151W 3399 nt1.91□□□□□ -2.1
SGO1Q08490 SBE22YHR103W 2559 nt1.9□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 MDS3YGL197W 4464 nt1.9□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YBR178WYBR178W 375 nt1.9□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.9□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 PDR8YLR266C 2106 nt1.9□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 HER1YOR227W 3741 nt1.89□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.89□□□□□ -2.11
SGO1Q08490 PKH2YOL100W 3246 nt1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms