Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LOXL1Q08397 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LOXL1Q08397 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms