Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRSF4Q08170 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms