Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4BQ07343 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4BQ07343 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms