Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms