Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LTBQ06643 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LTBQ06643 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LTBQ06643 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms