Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms