Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1T1Q06455 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1T1Q06455 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms