Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 RAD9YDR217C 3930 nt1.1□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 FIG4YNL325C 2640 nt1.1□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 YKL118WYKL118W 312 nt1.1□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 PTP2YOR208W 2253 nt1.1□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 NIP100YPL174C 2607 nt1.1□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 OST1YJL002C 1431 nt1.09□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 GPG1YGL121C 381 nt1.09□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 ANS1YHR126C 480 nt1.09□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 RPL34BYIL052C 366 nt1.09□□□□□ -2.23
YHC1Q05900 NUP188YML103C 4968 nt1.08□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SWI4YER111C 3282 nt1.08□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YLL007CYLL007C 1998 nt1.08□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YJR011CYJR011C 786 nt1.07□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.07□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YDL206WYDL206W 2289 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SEC3YER008C 4011 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YCK3YER123W 1575 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 NHP2YDL208W 471 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YDR413CYDR413C 576 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YFL032WYFL032W 321 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YLL020CYLL020C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 RRT15YLR162W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YPR063CYPR063C 423 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 MSN5YDR335W 3675 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 ALY2YJL084C 3141 nt1.06□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 RSM22YKL155C 1887 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YLR422WYLR422W 5799 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 NUP145YGL092W 3954 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 IFH1YLR223C 3258 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 HMRA2YCR096C 360 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YGL149WYGL149W 306 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 STO1YMR125W 2586 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 DBP6YNR038W 1890 nt1.05□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SMC1YFL008W 3678 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 PDE2YOR360C 1581 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 APL3YBL037W 3078 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SIP4YJL089W 2490 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SET3YKR029C 2256 nt1.04□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 SLD3YGL113W 2007 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YCS4YLR272C 3531 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 HTL1YCR020W-B 237 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 RPL39YJL189W 156 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 TRM732YMR259C 4263 nt1.03□□□□□ -2.24
YHC1Q05900 TTI1YKL033W 3117 nt1.02□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 APL1YJR005W 2103 nt1.02□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 SPO75YLL005C 2607 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 SSS1YDR086C 243 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YER097WYER097W 330 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YFL063WYFL063W 456 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YAR009CYAR009C 3591 nt1.01□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YDR521WYDR521W 336 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YIL032CYIL032C 357 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 WAR1YML076C 2835 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 SCC2YDR180W 4482 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 PAN2YGL094C 3348 nt1□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 STE5YDR103W 2754 nt0.99□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 VAM6YDL077C 3150 nt0.99□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 SPT7YBR081C 3999 nt0.99□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 snR60snR60 104 nt0.98□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 RPS25BYLR333C 327 nt0.98□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 NST1YNL091W 3723 nt0.98□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YGR130CYGR130C 2451 nt0.98□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 EAF1YDR359C 2949 nt0.97□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 ALG13YGL047W 609 nt0.97□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.97□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YBR206WYBR206W 324 nt0.97□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 CLU1YMR012W 3834 nt0.97□□□□□ -2.25
YHC1Q05900 YHL042WYHL042W 453 nt0.96□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.96□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YMR321CYMR321C 318 nt0.96□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 MDS3YGL197W 4464 nt0.96□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 ROM2YLR371W 4071 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 CSE2YNR010W 450 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 GEA2YEL022W 4380 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 VIK1YPL253C 1944 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 IML1YJR138W 4755 nt0.95□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 CDC39YCR093W 6327 nt0.94□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YJL120WYJL120W 324 nt0.94□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YOR218CYOR218C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 DOP1YDR141C 5097 nt0.94□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YDR344CYDR344C 444 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 RPS27BYHR021C 249 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 ECM12YHR021W-A 456 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YNL146WYNL146W 303 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 SPO21YOL091W 1830 nt0.93□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 INA22YIR024C 651 nt0.92□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 YBR064WYBR064W 429 nt0.92□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 COG8YML071C 1824 nt0.91□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 NUP157YER105C 4176 nt0.91□□□□□ -2.26
YHC1Q05900 OLI1Q0130 231 nt0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.4 ms