Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNEQ04844 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms