Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms