Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms