Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1BQ00975 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms