Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP1Q00587 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP1Q00587 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms