Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GTF2BQ00403 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2BQ00403 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms