Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX1P83916 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX1P83916 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX1P83916 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX1P83916 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms