Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms