Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms