Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNRPD3P62318 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNRPD3P62318 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms