Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNRPFP62306 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNRPFP62306 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms