Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1-1P60608 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1-1P60608 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms