Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCCD1P59942 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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