Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4BP1P59074 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms