Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CABP4P57796 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CABP4P57796 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CABP4P57796 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CABP4P57796 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms