Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSDMDP57764 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSDMDP57764 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms