Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNQ4P56696 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNQ4P56696 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms