Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME5P56597 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME5P56597 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME5P56597 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NME5P56597 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NME5P56597 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NME5P56597 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME5P56597 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME5P56597 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms