Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GFRA1P56159 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms