Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AQP4P55087 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
AQP4P55087 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AQP4P55087 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AQP4P55087 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms