Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD23BP54727 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms