Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLTCL1P53675 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLTCL1P53675 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms