Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SMARCA4P51532 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SMARCA4P51532 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SMARCA4P51532 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms